Komenda Formacji składa się z Dowódcy Formacji, zastępca Dowódcy, Szefa Sztabu Formacji i może być rozszerzona o dodatkowe dwie osoby funkcyjne. Członkowie Komendy Formacji na czas pełnienia funkcji zostają włączeni do Kontrwywiadu Korpusu oraz przechodzą szkolenie kontrwywiadowcze.
Zakres szkolenia jest niejawny. Stopnie kontrwywiadu nie są tożsame z rangami Korpusowców i są stopniami mianowanymi. Każde 2 lata pracy na rzecz Formacji w Komendzie upoważnia członka Komendy do szkolenia kontrwywiadowczego wyższej rangi. Rangi kontrwywiadowcze są noszone razem ze stopniami korpusowymi w formie patek na kołnierzyku albo wyszyte na rękawach marynarki. Znaki kontrwywiadowcze można nosić tylko w czasie gdy dana osoba pełni funkcje w Komendzie Formacji.
Oficerowe Kontrwywiadu Korpusu Paramilitarnego

Komandor podporucznik
Komandor podporucznik Kontrwywiadu Korpusu

Komandor porucznik
Komandor porucznik Kontrwywiadu Korpusu

Komandor
Komandor Kontrwywiadu Korpusu
Admiralicja Kontrwywiadu Korpusu Paramilitarnego

Kontradmirał
Kontradmirał Kontrwywiadu Korpusu

Wiceadmirał
Wiceadmirał Kontrwywiadu Korpusu
